Předběžný program - Struktura 2025

Pondělí 8. 9.

11:00 - 13.00 Registrace

13:00 Zahájení

		Milan Dopita, Jaromír Kopeček
13.15	František Laufek Česká geologická služba, Praha	Minerals within the Pd-Ni-As system: Crystal structures
13.45	Zdeněk Jansa Nové technologie - Výzkumné centrum, ZČU Plzeň	Fázová analýza půdních sedimentů s ohledem na přítomnost azbestových minerálů Phase analysis of soil sediments with respect to presence asbestos minerals
14.10	Cristian Pilloni Faculty of Sciemce, Charles University, Prague	Properties of Schwertmannite: The Critical Role of Phase Purity
14.35	Esther de Prado Fyzikální ústav AV ČR, Praha	Improving thermoelectric efficiency of multilayer ScN/Sc_1-xNb_xN heterostructures by Nb doping
15.00	Jan Drahokoupil Fyzikální ústav AV ČR, Praha	Tenké vrstvy BaTiO₃/LaNiO₃: od difrakce k počítačovým simulacím.

15.25 Přestávka

		Stanislav Daniš, Nikolaj Ganev
15.50	Petr Machovec Matematicko-fyzikální fakulta UK Praha	Halide Segregation in Mixed-Halide Perovskites studied by XRD
16.15	Dominik Farka Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích	Thiophene-Based Conductive Polymers: Structural Order vs. Charge-Transport
16:40	Petr Doležal Matematicko-fyzikální fakulta UK Praha	Polymorphs of Zn_xCu_4-x(OH)₆Cl₂ and their physical properties
17.05	Jamil Eduardo Flores Gonzales Institute of Physics, Czech Academy of Sciences, Praha	Diffuse scattering in (K,Na)NbO₃ solid solutions


Kursy
17:30	Radomír Kužel Matematicko-fyzikální fakulta UK Praha	Reálná struktura a total powder pattern fitting (viz Struktura 2018, nebo časopis MS)
17:50	Zdeněk Matěj Max IV Laboratory, Lund, Švédsko	Možnosti programu MSTRUCT a úvod do kursu MSTRUCT



17:30	Petr Kolenko Fakulta jaderná a fyzikálně inženýrská ČVUT, Praha	Úvod do kursu Moorhen

Kurs programu MSTRUct
Kurs Moorhen
(níže)

19.30 Večeře

20.30 Kursy, pokračování

Úterý 9. 9.

7.00 Snídaně

		Václav Holý
8.30	Stanislav Daniš Faculty of Mathematics and Physics, Charles University, Praha	Data a co snimi Data and what to do with it
9.15	Vojtěch Chlan Faculty of Mathematics and Physics, Charles University, Praha	Nuclear magnetic resonance in solids
10.00	Lukáš Horák Faculty of Mathematics and Physics, Charles University, Praha	Selected examples in X-ray reflectometry

10.30 Přestávka, občerstvení


		Jaroslav Maixner
11.00	Michal Dušek Institute of Physics, Czech Academy of Sciences, Praha	První zkušenosti s monokrystalovým difraktometrem Synergy R First experience with single crystal diffractometer Synergy R
11.25	Jiří Zelenka Institute of Physics, Czech Academy of Sciences, Praha	Interpretation of Electron Density Maps Using Neural Networks
11.50	Jan Rohlíček Institute of Physics, Czech Academy of Sciences, Praha	Use of intermolecular distances in solving structures from powders

12.30 Oběd

		Petr Pachl, Petr Kolenko
14.00	Jindřich Hašek Institute of Biotechnology, Czech Academy of Sciences, Vestec	Crystallization of biomolecules
14.30	Jan Dohnálek Institute of Biotechnology, Czech Academy of Sciences, Vestec	Information on protonation in biomolecular structures
14.55	Bohdan Schneider Institute of Biotechnology, Czech Academy of Sciences, Vestec	Advances in annotation and validation of nucleic acids
15.20	Jiří Brynda Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Czech Academy of Sciences, Praha	Crystal structure of blue laccase BP76, a unique termite suicidal defense weapon

15.45 Přestávka, občerstvení

		Jan Dohnálek, Bohdan Schneider
16.15	Petr Kolenko Faculty of Nuclear Sciences and Physical Engineering, Czech Technical University, Praha	Crystal Structure of PROSS-edited Human Interleukin 24
16.40	Barbora Kaščáková Faculty of Science, University of South Bohemia in České Budějovice	Characterization of PROTAC-508: A Cereblon-Recruiting Degrader of Enteroviral 2A Protease
16.55	Petra Havlíčková Faculty of Science, University of South Bohemia in České Budějovice	Beyond Oncogenes: How Ras–MAPK Variants Influence Neurodevelopment


17.30	Radomír Kužel Matematicko-fyzikální fakulta UK, Praha	Informace o přípravách ECM-36 v Praze v roce 2027
17.40	Jan Walla, Boris Míč Měřící technika Morava	Ukázka stolního dikraktometru D6 PHASER

19.20 Večeře

20.30 Schůze vědecké rady Krystalografické společnosti a regionálního komitétu IUCr

Středa 10. 9.

7.00 Snídaně


		Daniel Šimek
8.30	Václav Holý Matematicko-fyzikální fakulta UK, Praha	Hard x-rays with orbital momentum, properties and dynamical diffraction
9.10	Jozef Bednarčík Univerzita P.J. Šafárika, Košice	Štúdium lokálnej atomárnej štruktúry neusporiadaných materiálov pomocou in-situ synchrotrónových experimentov
9.35	Milan Dopita Matematicko-fyzikální fakulta UK, Praha	Light-Induced Phase Segregation and Structural Relaxation in Mixed-Halide Perovskites. FeOH nanoparticles
10.00	Jiří Špringer Anton Paar	Anton Paar, SAXSpoint 500/700 - nová zařízení pro malúhlový rozptyl
10.20	Szymon Stolarek Xenocs, SAS	Enabling Nanoscale Insight: Advanced X-ray Scattering Solutions from Xenocs

10.40 Přestávka


		Jan Rohlíček, Michal Dušek
11.10	Pawel Olowek Rigaku	XSPA: the future of XRD
11.30	Stjepan Prugovečki Panalytical	New functions of XRD Empyrean
11.50	Miroslav Lebeda FJFI, ČVUT Praha	XRDlicious: An Online Tool for Powder Diffraction Pattern and RDF Simulation from Crystal Structures
12.15	Zdeněk Matěj Max IV Laboratory, Lund, Švédsko	Basic crystallographic algorithms in the ML language
12.45	Jan Drahokoupil Fyzikální ústav AV ČR, Praha Miroslav Lebeda FJFI ČVUT Praha	Introduction to Mace course

13.15 Oběd

14.30 Shromáždění členů Krystalografické společnosti

16.00-18.00 Návštěva muzea amerických veteránů a pivovaru v Nové Bystřici

19.00 Raut ve Wellness penzionu Life v Číměři (majitelka Anita Župčanová)

Čtvrtek 11. 9.

7.00 Snídaně


*Large European Neutron Facilities*		Milan Klicpera
8.30	Mark Johnson ILL Grenoble	Institute Laue-Langevin - instrument and infrastructure upgrades, the science strategy and new research opportunities
9.10	Michael Hofmann MLZ, Munich, Germany	Diffraction at MLZ
9.50	Přemysl Beran ESS, Lund	ESS News and first science oportunities

10.30 Přestávka, občerstvení


Neutron Science in Czech Republic 1		Přemysl Beran
11.00	Jan Šaroun Ústav jaderné fyziky AV ČR, Řež	Neutron diffraction laboratory in Řež and its user program
11.20	Milan Klicpera Matematicko-fyzikální fakulta UK, Praha	Czech neutron association - establishment, mission, and objectives
11.30	Pavel Strunz Ústav jaderné fyziky AV ČR, Řež	Residual-stress distribution in components fabricated with involvement of additive manufacturing
	Olena Levytska, Pavel Strunz Ústav jaderné fyziky AV ČR, Řež	Validation of contour cut model for residual stresses in AM-repaired simulated defect by neutron diffraction
12.00	Jiří Kulda ILL Grenoble, France	Pump-probe inelastic neutron scattering experiments

12:30 Oběd


Neutron Science in Czech Republic 2		Pavel Strunz, Jan Šaroun
14.00	Gergely Farkas Ústav jaderné fyziky AV ČR, Řež	Experimental determination of critical resolved shear stresses by neutron diffraction
14.20	Vasyl Ryukhtin Ústav jaderné fyziky AV ČR, Řež	Investigations of vortex lattices and skyrmions using neutron scattering
14.40	Filip Hájek Matematicko-fyzikální fakulta UK, Praha	Novel pyrochlore-derived structure in rare-earth iridate single crystals
15.00	David Sviták Matematicko-fyzikální fakulta UK, Praha	Magnetic structure and excitations in the antiferromagnet Na₂BaMn(PO₄)₂
15.20	Romain Conan Přírodovědecká fakulta UK, Praha	Magnetic correlation in functionalized supraparticles
15.40	Štefan Hricov Matematicko-fyzikální fakulta UK, Praha	Magnetic morphology of multishell nanoparticles

16:00 Přestávka, občerstvení


		Zdeněk Matěj, Pavla Roupcová
16.20	Štepán Venclík Faculty of Mathematics and Physics, Charles University, Praha	LaueDB: A dataset for Laue patterns
16.40	Petr Cejpek Institute of Physics, Czech Academy of Sciences, Praha	PSB_GUI – Matlab routine for the refinement of residual stresses, microstrain and crystallite shape in cubic materials
17.00	Ubaid Ahmed Fyzikální ústav AV ČR, Praha	Effect of Heat Treatment on Ti6Al4V porosity and micromechanical behavior
17.20	Jaromír Kopeček Fyzikální ústav AV ČR, Praha	Mikrostruktura měděných rotačně kovaných tyčí s příměsí uhlíkaté frakce
17.40	Jan Drahokoupil Fyzikální ústav AV ČR, Praha Miroslav Lebeda FJFI ČVUT Praha	Kurs Mace

19:30 Večeře

Pátek 12. 9.

7.00 Snídaně



9.00	Radomír Kužel Matematicko-fyzikální fakulta UK, Praha	Y-hexaferrite thin films deposited by chemical solution deposition on different substrates studied by XRD
9.30	Možné pokračování kursů MSTRUCT a MACE

Kurzy

Moorhen
Lucrezia Catapano, Petr Kolenko

Moorhen is a modern, web-based application that brings the powerful functionalities of the Coot model-building software to the browser. Built with React and leveraging the libcoot API, Moorhen offers an intuitive, interactive graphical interface for macromolecular model building, refinement, and validation.
Moorhen enables users to perform interactive model editing, refinement, and the creation of high-quality figures directly in the browser—without the need to install additional software. All visualisation and refinement calculations are executed client-side, delivering a seamless experience with near-native performance.
Moorhen is available as a standalone web app at moorhen.org and is also integrated into the CCP4 Cloud graphical user interface (GUI) and the CCPEM Doppio interface.
The introductory tutorial will demonstrate the full range of tools available in Moorhen for real-space refinement—including features such as auto-fit rotamer, peptide flipping, and other model optimization functions. It will also cover the integrated validation tools, ligand fitting workflows, and strategies for creating high-quality figures directly within the browser.

MSTRUCT
Zdeněk Matěj, Milan Dopita, Lukáš Horák

Program na zpracování práškových difraktogramů včetně asymetrických skenů (prášky, objemové materiály, zejména tenké vrstvy) se zaměřením na analýzu reálné struktury (velikost krystalitů a jejich distribuce, hustota dislokací, zbytkové napětí, uvážení textury)

mace-md-gui
Miroslav Lebeda, Jan Drahokoupil

Kurs počítání pomocí meziatomových potenciálů a přípravu strukturních souborů. Grafické rozhraní (M. Lebeda) používá strojově naučený meziatomový potenciál na data z databáze Materials Project - MACE. Toto rozhraní umožňuje snadno počítat energie, elastické konstanty, fonony či provádět geometrickou optimalizaci. Zpřístupňuje tedy počítačové simulace i lidem, které nemají v této oblasti skoro žádné zkušenosti. Pro představu video. Ukázka přípravy strukturních souborů pomocí nástroje ATOMSK.

Předběžný program - Struktura 2025

mace-md-gui Miroslav Lebeda, Jan Drahokoupil

mace-md-gui
Miroslav Lebeda, Jan Drahokoupil