Preliminary programme
 Computing methods in X-ray and neutron structure analysis

Nové Hrady 2003

Monday 16. 6.

10:00-13.30 Registration
13:30 Introduction
13:45 Institute of physical biology (D. Štys)

14:00 To the memory of Lida Dobiasova (R. Kužel)
           L. Dobiášová, R. Kužel, H. Šíchová: Powder diffraction study of egg-shell microstructure

 14.30-19.00  

Z. Šourek, J. Fiala

 

Jiří Komrska
Fakulta strojního inženýrství, VUT Brno

Fourier methods in diffraction theory and structure analysis

  přestávka  
 Databases, structure visualization, Internet
 
  Karel Huml
Ústav makromolekulární chemie AV ČR, Praha
Structure data analysis
  Bohdan Schneider
Centrum pro komplexní molekulární systémy, AV ČR Praha
Use of structure databases PDB and NDB
  Jindřich Hašek 
Ústav makromolekulární chemie, 
AV ČR Praha
Structue and function of macromolecular systems (CSD)
  Radomír Kužel
MFF UK Praha
PDF-2, ICSD, Crystmet, Pauling file, databases on Internet
 

Michal Hušák
VŠCHT Praha

Review of software for structure visualization


19.00 Dinner
19.30 Instalation of posters, cultural programme


Tuesday 17. 6.

7.30  Breakfeast

Powder diffraction, phase analysis

M. Čerňanský, A. Buchal

8.30

Radomír Kužel
MFF UK Praha

Information in powder diffraction pattern and its evaluation

  Jaroslav Fiala
Fakulta strojní, ZČU Plzeň
Qualitative phase analysis (search-match)
  přestávka
  Petr Ondruš
Geologický ústav, Praha
Phase analysis with the use of PDF-2 and PDF-4 databases, channel search-match algorithms
  Miroslav Krupka
PCS s.r.o, Praha
New software Philips High Score for phase identification
  Jiří Had 
VŠCHT Praha
Comparion of programs XDAL, Diffrac, Eva a X´Pert
  Marek Kotrlý
Kriminalistický ústav, Praha
Identification of particles of modern colour pigments by X-ray methods
10.00-12.30 Computer room  
  Schneider, Hašek, Hušák, Císařová

Databases, structure visualization 

12.30 Lunch

 Student presentations

R. Kužel, N. Ganev, I. Kutá Smatanová

14.00

Stanislav Němeček
Nové technologie - výzkumné centrum, Plzeň

Image analysis in frequency space

  Jan Drahokoupil
FJFI ČVUT Praha
Determination of particle size and strain by the Williamson-Hall plot and method of the shape factor
  Viktoria Cherkaska
MFF UK, Praha
X-ray diffraction study of submicrocrystalline materials
  Zdeněk Matěj
MFF UK, Praha
X-ray diffraction line profile analysis
  Daniel Šimek
FzU AV ČR Praha, MFF UK, Praha
Reciprocal space map fitting, study of TiB2 films
  Milan Dopita
MFF UK, Praha
XRD diffraction analysis of polycrystalline thin films
  Khrystyna Miliyanchuk
MFF UK, Praha

Structure and properties of f-metal hydrides

  Hana Petříčková
VŠCHT Praha
Strukcture analysis of morfinan alkaloids
  Blanka Klepetářová
VŠCHT Praha
Solvatomorphy of  námelových alkaloids
  Milan Burčák
Prírodovedecká fakulta UJPŠ Košice
Structur solution of copper complexes containing [PF6]- anions
  Miroslava Malárová
Prírodovedecká fakulta UJPŠ Košice
Structur solution of hexakyanocomplexes
  Vladena Hlinková
Ústav molekulárnej biológie, SAV Bratislava
Crystallization and structure determination of complexes ribonuclease Sa2 with 3´-GMP and 2´,3´-GCPT

19.00    Dinner
20.00    Election of scientific board - results

20.30    Meeting of the scientific board and regional committee of the IUCr


Wednesday 18. 6.

7.30    Breakfeast

 Structure solution – single crystals

B. Schneider, P. Řezáčová

8.30

Václav Petříček, Michal Dušek
Fyzikální ústav AV ČR Praha

Structure solution  (sylabus)

  přestávka  
  Jiří Brynda
Ústav molekulární genetiky AV ČR, Praha
Data reduction - theory and comparison of programs
(XDS, Denzo, Mosflm) 
  Tomáš Obšil
Přírodovědecká fakulta UK, Praha
Phase determination: molecular replacement
11.00-13.00  Computer room   
  Ondruš, Krupka, Kužel

Phase analysis, powder diffraction

13.00  Lunch

Trip

19:00 Dinner

20.00 Poster session

21:00 Assembly of the Czech and Slovak Association


Thursday 19. 6.

7.30 Breakfeast

Structure determination - powders

J. Fiala, J. Maixner

8.30 Radovan Černý 
University of Geneve, Switzerland
Structure determination and refinement. Program FOX (sylabus)
  Stanislav Daniš 
MFF UK Praha

Rietveld analysis. Fullprof a GSAS.

  Radomír Kužel
MFF UK Praha
Real structure - description
Program Maud
11.00-13.00  Computer room   
  Dušek, Petříček

Structure solution - single crystals

 12.30 Lunch

Structure solution – single crystals, proteins

J. Hašek, P. Čapková

14.00

Jiří Brynda 
ÚMG AV ČR, Praha
Methods of experimental phasing (MAD, MIR, SAD)
  Jitka Vévodová 
Přírodovědecká fakulta MU, Brno
Structure refinement of proteins
  Jan Ondráček
Ústav molekulární genetiky AV ČR Praha
Structure refinement of proteins from high-resolution diffraction data  (SHELX)
  Pavlína Řezáčová 
Ústav molekulární genetiky AV ČR Praha
Structure analysis of proteins and structure validation (Procheck, Whatchek, SFcheck)
17.00 Short contributions  
  Jiří Kameníček 
Přírodovědecká fakulta UP, Olomouc
Structure of  nickel complex with dithiocarbamate and P,P-ligand with  coordinataion number 5.
14.00-18.00  Computer room  
  Černý, Daniš, Kužel

Structure refinement from powder diffraction


18.00    Poster session

20.00      Conference dinner


Friday 20. 6.

7.30 Breakfeast

 Modelling, charge densities

J. Kameníček, V. Petříček

8.30

Pavla Čapková 
Matematicko-fyzikální fakulta UK, Praha
Combination of modelling, X-ray diffraction and IR spectroscopy in structure analysis of partially ordered structures
  Bohdan Koudelka 
Matematicko-fyzikální fakulta UK, Praha
Supramol – program for structure solution in direct space
  Tereza Skálová 
Ústav makromolekulární chemie AV ČR, Praha
Molecular modelling of biomolecules
  Miroslav Šlouf
Ústav makromolekulární chemie AV ČR, Praha
Charge densitites and topological analysis
Powder diffraction, real structure

R. Černý, N. Ganev

  Martin Černík 
U.S. Steel, Košice
Texture analysis. Texture of rolled steel sheets
  Jiří Marek 
Fakulta jaderná a fyzikálně inženýrská, ČVUT Praha
Texture visualization
  Marian Čerňanský 
Fyzikální ústav AV ČR, Praha
Deconvolution methods
  Radomír Kužel 
MFF UK, Praha
Line profile analysis
10.30-13.00  Počítačová učebna   
  Brynda, Vévodová, Obšil

Structure solution - macromolecules (Brynda, Vévodová, Obšil)

13:00    Closing ceremony

13:15    Lunch