Ústav chemie pevných látek, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Technická 5, 166 28 Praha 6

Programy, které jsou k dispozici pro zobrazování struktur leze roztřídit podle celé řady parametrů: dostupnost - komerční software, volně dostupný software … podporované operační systémy - Win32 API (Windows 98,NT,2000,XP), Linux, Irix … podporované vstupní formáty dat - CIF, Shelx, CSD, PDB … podporované technologie zobrazení - 2D grafika, 3D OpenGL HW akcelerovaná grafika, raytracing …Dalšími parametry, které jsou pro uživatele z oblasti krystalografie zajímavé jsou např. schopnosti zobrazovat mapy prostorových funkcí (elektronové hustoty, silové pole), generovat větší část prostoru přes operace symetrie, zobrazovat výsledky molekulárně dynamických simulací, přímá integrace se softwarovými balíky pro řešení struktur.

Neexistuje žádný program, který by byl natolik univerzální, že by splňoval veškeré požadavky v jednom kódu. Ve svém příspěvku provedu demonstraci následujících programů z hlediska podporovaných funkcí a jejich vhodnosti pro řešení krystalografických problémů. Výběr programů byl proveden tak, aby přehled pokrývaly většinu různorodých požadovaných vlastností . Dalším kritériem pro zahrnutí programu do přehledu byly praktické zkušenosti s jeho využíváním.

Název programu	Dostupnost	Podporované OS	Podpora krystalografických dat	Řešení grafického výstupu	Primární účel programu	Distribuce
Ortep 3	zdarma	Win32, Linux	ano	GDI/raytracing	Vizualizace krystalografických struktur	http://www.chem.gla.ac.uk/~louis/software/ortep3/
Mercury	zdarma	Win32, Linux, Irix	ano	OpenGL	Interpretace dat z CSD	http://www.ccdc.cam.ac.uk/
DS Viewer (Pro + Litte)	komerční / zdarma	Win32	částečně	OpenGL raytracing	Univerzální vizualizace a analýza struktury	http://www.accelrys.com/
Hyperchem 7.1	komerční	Win32	částečně	GDI/raytracing	Simulace chování molekul přes MM i QM	http://www.hyper.com/
VMD	zdarma	Win32, Linux, Irix	částečně	OpenGL raytracing	Univerzální vizualizace a analýza struktury	http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
CRYSTALS	zdarma	Win32, Linux, Irix	ano	OpenGL	Řešení struktur malých molekul	http://www.xtl.ox.ac.uk/
O	komerční /zdarma	Win32, Linux, Irix	ano	OpenGL	Řešení struktur proteinů	http://origo.imsb.au.dk/~mok/o/
MCE	zdarma	Win32	CRYSTALS-WinGX integrace	OpenGL/ raytracing	Vizualizace map elektronových hustot	http://mysak.umbr.cas.cz/~husakm/ Public/MarchingCubeELD/MarchingCubeELD.htm